IDENTIFIKASI DAN PEMETAAN TERHADAP SEBUAH GEN INTI

IDENTIFIKASI DAN PEMETAAN TERHADAP SEBUAH GEN INTI

Download File

IDENTIFIKASI DAN PEMETAAN TERHADAP SEBUAH GEN INTI.docx

 keyword :

  nama ahmad safii cs triani f raka aminullah resume identification and mapping of a gene for rice slender kernel using oryza glumaepatula introgression lines identifikasi dan pemetaan terhadap sebuah gen inti pada yang paling kecil menggunakan garis intrograsi oryza glumaepatula abstract the objectives of this study were to identify and map a gene for rice slender kernel trait using oryza glumaepatula introgression lines with o sativa cv introduction the human population and economic growth were impact to the demand for superior rice grain quality as well as quantity tends to increase the world demand for rice has been projected to increase by 25 from 2000 to 2025 in many countries the importance of improving rice quality is increasingly becoming priority to improve competitiveness therefore combining the improvement for hight yield ang hight grain quality is an important breedeing objective for rice breeders the rice grain quality include milling effeciency appeareance cooking and edibility characteristics and nutritional quality the present study aimed to identify and map a gene for slender kernel of rice using bc4f2 segregation population materials and methods plant materials a brazilian wild rice o glumaepatula acc irgc 105668 and a japonica cultivated rice o sativa cv this population consisted of 55 plants genomic dna extraction and rflp analysis the isolated dna 2.5 μg each was digested with eight restriction enzymes apal bamhi dral ecori ecorv hindlii and kpnl separated by 0.8 agarose-gel electrophoresis and blotted onto hybond n membranes amersham by capilarry transfer using 0.4 n naoh solution the blotted membranes were rinsed in 2x ssc dries and baked at 120°c for 20 minutes data analysis the null hypothesis of the test ws thatprogrnies segregated in a 3 1 ratio of which the alleles were derived from the firts and second parents respectively page 2 of 4 result and discussion result of the analysis using 14 rflp markers located on these chromosomes revealed that the slender kernel gene was located on chromosome 2 out of 21 plants with slender kernel 20 plants were homozygous for o glumaepatula allele at rflp marker c560 of chromosome 2 and one plant was heterozygous out of 34 plants with normal kernels 10 plants were homozygous for taichung 65 allele at c560 and 24 plants were heterozygous tablle 1 these result confirmed that slender kernel was controlled by a single recessive gene and this gene tightly linked with rflp marker c560 one slender kernel plant carrying heterozygous allele at c560 was considered as a recombinant between the loci of slender kernel and rflp marker c560 at this locus o glamepatula has a recessive allele therefore this slender kernel gene was considered as a newly identified gene and desaignated as sk1 slender kernel 1 to map the sk1 gene on the rflp linkage map rflp analyses were conducted between sk1 and rflp markers located araound c560 the result revealed that sk1 gene was located between rflp markers c679 and c560 on the long arm of chromosome 2 with map distance of 2.8 and 1.5 cm respectively fig 3 understanding the molecular mechanisms involved in grain size along with quantitative and qualitative genetic data will provide new strategies to develop rice varieties with desired level of grain size in the bc4f2 population used in this study a recessive allele for slender kernel ooriginated from wild rice o glamaepatula since most indonesian rice consumers prefer long and sllender grains this allele might be a valuable new source for introgression and improvement of rice varieties having slender kernel conclusion on the long arm of chromosome 2 with map distance of 2.8 and 1.5 cm respectively this finding provides a new genetic resource for grain shape improvement of rice varieties and the closely linkage markers that flank the identified gene should be very useful when transferring the gene in breeding program page 3 of 4 abstrak tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi dan memetakan gen untuk beras sifat kernel ramping menggunakan oryza glumaepatula garis introgresi dengan o sativa cv pengantar populasi manusia dan pertumbuhan ekonomi yang berdampak pada permintaan untuk kualitas gabah unggul serta kuantitas cenderung meningkat permintaan dunia terhadap harga beras telah diproyeksikan meningkat sebesar 25 dari tahun 2000 sampai tahun 2025 di banyak negara pentingnya meningkatkan kualitas beras semakin menjadi prioritas untuk meningkatkan daya saing oleh karena itu menggabungkan perbaikan untuk hight hasil ang kualitas gabah hight merupakan tujuan breedeing penting bagi peternak beras kualitas gabah meliputi penggilingan efisiensi appeareance memasak dan karakteristik sifat dpt dimakan dan kualitas gizi penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan memetakan gen untuk kernel ramping padi menggunakan bc4f2 populasi segregasi bahan dan metode bahan tanaman sebuah nasi brasil o glumaepatula acc irgc 105.668 dan padi dibudidayakan japonica o sativa cv populasi ini terdiri dari 55 tanaman ekstraksi dna genomik dan analisis rflp dna terisolasi 2 5 mg masing-masing itu dicerna dengan delapan enzim restriksi apal bamhi dral ecori ecorv hindlii dan kpnl dipisahkan oleh 0 8 agarosa-gel elektroforesis dan diblot ke hybond n membran amersham melalui transfer kapiler menggunakan 0 4 n larutan naoh yang dihapuskan membran dibilas 2x ssc mengering dan dipanggang pada suhu 120 ° c selama 20 menit analisis data hipotesis nol dari uji ws thatprogrnies terpisah dalam rasio 3 1 dimana alel berasal dari menggoda dan orang tua kedua masing-masing hasil dan pembahasan hasil analisis menggunakan 14 rflp penanda terletak pada kromosom tersebut mengungkapkan bahwa gen ramping kernel terletak pada kromosom 2 dari 21 tanaman dengan kernel ramping 20 tanaman yang homozigot untuk o glumaepatula alel pada rflp penanda c560 kromosom 2 dan satu pabrik adalah heterozigot dari 34 tanaman dengan kernel normal 10 tanaman yang homozigot untuk taichung 65 alel pada c560 dan 24 tanaman yang heterozigot tablle 1 hasil ini menegaskan bahwa kernel ramping dikendalikan oleh gen resesif tunggal dan gen ini terkait erat dengan rflp penanda c560 satu ramping pabrik kernel membawa alel heterozigot pada c560 dianggap sebagai rekombinan antara lokus kernel langsing dan marka rflp c560 pada lokus ini o glamepatula memiliki alel resesif oleh karena itu gen ini kernel ramping dianggap sebagai gen yang baru diidentifikasi dan desaignated sebagai sk1 kernel ramping 1 untuk memetakan gen sk1 pada rflp linkage peta analisis rflp dilakukan antara sk1 dan rflp penanda terletak araound c560 hasil penelitian menunjukkan bahwa sk1 gen terletak page 4 of 4 antara penanda rflp c679 dan c560 pada lengan panjang dari kromosom 2 dengan peta jarak 2 8 dan 1 5 cm masing-masing gambar 3 memahami mekanisme molekuler yang terlibat dalam ukuran butir bersama dengan data kuantitatif dan kualitatif genetik akan memberikan strategi baru untuk mengembangkan varietas padi dengan tingkat yang diinginkan ukuran butir pada populasi bc4f2 digunakan dalam penelitian ini alel resesif untuk kernel ramping ooriginated dari nasi o glamaepatula karena kebanyakan konsumen beras indonesia lebih memilih biji-bijian yang panjang dan sllender alel ini mungkin menjadi sumber baru yang berharga untuk disisipkan dan perbaikan varietas padi yang memiliki kernel ramping kesimpulan pada lengan panjang kromosom 2 dengan peta jarak 2 8 dan 1 5 cm masing-masing temuan ini menyediakan sumber daya genetik baru untuk gandum perbaikan bentuk varietas padi dan spidol erat keterkaitan yang mengapit gen yang diidentifikasi harus sangat berguna ketika mentransfer gen dalam program pemuliaan 4 of 4 displaying resume.docx